Marc Marquez al mattino, Andrea Dovizioso nel pomeriggio. I due avversari per il titolo mondiale si dividono il comando delle operazioni nella prima giornata di prove libere del Gp di Motegi, ottima la prestazione del pilota della Ducati che, nelle FP2, beffa di 43 millesimi lo spagnolo protagonista anche di una fastidiosa caduta.
Terza posizione per un sorprendente Aleix Espargaro, capace di sopravanzare proprio nel finale la Ducati di Lorenzo. Quinto tempo per Johann Zarco, seguito poi dalla coppia italiana formata da Danilo Petrucci e Andrea Iannone. Chiude ottavo invece Dani Pedrosa, seguito da Crutchlow e Rins. Continuano a faticare le Yamaha, entrambe fuori dalla top ten. Undicesima posizione per Maverick Viñales, seguito a ruota da Valentino Rossi, distante ben un secondo e mezzo dalla vetta.